Il sistema di gradiometria (FM-256 della Geoscan Research) permette di registrare le più piccole variazioni di intensità e orientamento del campo magnetico su larga scala. Dal momento che le differenti strutture archeologiche, in particolar modo gli oggetti metallici, le combustioni (contesti abitativi, forni) e la movimentazione del terreno (silos, tombe e cave) presuppongono una alterazione nel magnetismo naturale del sottosuolo, è possibile individuarle mediante questo sistema di prospezione. È il sistema più rapido, con il quale si può coprire uno spazio di 3800m² in un giorno di prospezione, a seconda delle condizioni del terreno.