Le gradiomètre magnétique (FM-256 Geoscan Research) permet de mesurer les variations de la composante verticale du champ magnétique entre les deux capteurs, séparés de 50 cm. Tout objet ayant une susceptibilité magnétique différente de celle de son environnement génère un contraste magnétique. C’est pourquoi les structures archéologiques, et spécialement les métaux, les structures de combustion (foyer, four) et les terres remaniées (tranchées, silos, tombes) sont aisément détectés par ce dispositif. La méthode magnétique, permettant de cartographier environ 3800m2 par jour en fonction des conditions de terrain, est de plus l'une des méthodes de prospection les plus rapides.